ছাত্র-জনতার আন্দোলনের মুখে আওয়ামী লীগ সরকারের পতনের পর বিশ্ববিদ্যালয়ে নানা অনিয়ম অভিযোগের দায়ে ছাএ-ছাএীরা তৎকালীন ভিসি ও প্রো ভিসির পদত্যাগের দাবি উত্থাপন করে এবং বিশ্ববিদ্যালয়ের সাধারণ শিক্ষার্থীদের তোপের মুখে ১৮ আগস্ট পদত্যাগ করেন তৎকালীন রাঙামাটি বিজ্ঞান ও প্রযুক্তি বিশ্ববিদ্যালয়ের উপচার্য প্রফেসর ড.সেলিনা আক্তার এবং উপ উপচার্য প্রফেসর ড. কাঞ্চন চাকমা।

এতে স্থবির হয়ে পড়েছে বিশ্ববিদ্যালয়ের প্রশাসনিক কার্যক্রম। উপাচার্য না থাকায় নিয়োগপ্রক্রিয়া, পদোন্নতি, প্রশাসনিক রদবদল আটকে আছে। এমতবস্থায় উপাচার্য নিয়োগের দাবি জানিয়েছে শিক্ষার্থীরা।

এছাড়াও সাম্প্রতিক সময়ের বিভিন্ন সাম্প্রদায়িক ইস্যুর কারণেও বিশ্ববিদ্যালয়ের সশরীরে সকল রকমের ক্লাস ও পরীক্ষা স্থগিত ছিলো।